У одного из пользователей по каким то мистическим причинам оказалось 3 папки "Мои документы" с разными id. Как можно удалить 2 из них?
Удалить их можно скриптом в тестовом процессе, через эмуляцию сценария без отката. То есть загрузить по id папку, которую нужно и удалить ее. Либо напрямую в БД. Но я бы порекомендовал с таким вопросом обратиться в службу поддержки, т.к. может быть нужно выполнить еще какие-то действия (убрать или исправить какие-нибудь ссылки на папки), точно это только там подскажут. Ну и в любом случае перед удалением папок сделайте резервную копию БД, на случай если что-то пойдет не так, чтобы можно было откатиться.